Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TapbpQ9R233 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TapbpQ9R233 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms