Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b2Q9R0K7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b2Q9R0K7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms