Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms