Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms