Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Trpc3Q9QZC1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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