Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pdzd4Q9QY39 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pdzd4Q9QY39 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pdzd4Q9QY39 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pdzd4Q9QY39 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pdzd4Q9QY39 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pdzd4Q9QY39 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pdzd4Q9QY39 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd4Q9QY39 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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