Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcsk1nQ9QXV0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms