Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip4Q9QXN3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms