Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apbb1Q9QXJ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms