Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyhr1Q9QXA1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms