Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl2Q9QUK0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms