Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms