Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thsd1Q9JM61 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thsd1Q9JM61 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms