Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp1Q9JLK7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms