Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms