Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bace2Q9JL18 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms