Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms