Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms