Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK23

Psmg1, Proteasome assembly chaperone 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg1Q9JK23 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg1Q9JK23 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg1Q9JK23 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms