Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms