Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms