Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms