Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms