Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI5

Jmjd6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd6Q9ERI5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd6Q9ERI5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jmjd6Q9ERI5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms