Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms