Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn4aQ9ER60 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn4aQ9ER60 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms