Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms