Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms