Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn1Q9EPL2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms