Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl4Q9DCU6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms