Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ndufs3Q9DCT2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms