Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms