Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms