Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms