Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf4Q9DAW6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms