Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift43Q9DA69 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift43Q9DA69 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift43Q9DA69 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift43Q9DA69 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift43Q9DA69 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift43Q9DA69 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift43Q9DA69 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift43Q9DA69 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift43Q9DA69 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms