Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd8Q9DA37 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms