Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp12Q9D9M2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms