Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms