Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9H8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9H8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D9H8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9D9H8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D9H8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D9H8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms