Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SlirpQ9D8T7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms