Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c6Q9D8P7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms