Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms