Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms