Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jam3Q9D8B7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms