Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms