Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms