Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slx4ipQ9D7Y9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms