Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms