Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms